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独習 Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) [単行本]

独習 Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) [単行本]

HK$659.00
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商品描述

独習 Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) の 商品概要

  • 目次

    第1章 この本の使い方と事前準備 
    1.1 Python を用いる理由 
    1.2 プログラミングを行うためのマシンの用意 
    他 

    第2章 Jupyter Notebook の使い方 
    2.1 Jupyter Notebook の基本操作 
    2.2 Jupyter Notebook の便利な機能 
    他 

    第3章 Python 速習コース 
    3.1 はじめに 
    3.2 関数とメソッド 
    他 

    第4章 文字列処理の基本 ~ファイルの読み書き,正規表現 
    4.1 文字列処理 
    4.2 ファイルの読み書き 
    他 

    第5章 Biopython を用いた塩基配列データの扱い方 ~オブジェクト指向入門 
    5.1 クラスを利用したプログラミング 
    5.2 Biopython を使った配列ファイルの読み書き 
    他 

    第6章 pandas はじめの一歩 ~表形式データの扱い方 
    6.1 準備 
    6.2 Series 
    他 

    第7章 RNA-Seq カウントデータの処理 ~pandas 実践編 
    7.1 準備 
    7.2 データファイルの読み込みとアノテーション 
    他 

    第8章 データの可視化 ~Matplotlib,Seaborn を用いたグラフ作成 
    8.1 解析環境のセットアップおよびデータの準備 
    8.2 Matplotlib ライブラリの使い方 
    他 

    第9章 統計的仮説検定 ~RNA-Seq データを用いた検定の基本からモデル選択まで 
    9.1 必要ライブラリのimport 
    9.2 基本的な用語や概念 
    他 

    第10章 シングルセル解析1 ~テーブルデータの前処理 
    10.1 はじめに 
    10.2 データの前処理 
    他 

    第11章 シングルセル解析2 ~次元削減 
    11.1 データ読み込み 
    11.2 主成分分析 
    他 

    第12章 シングルセル解析3 ~クラスタリング 
    12.1 データ読み込み 
    12.2 階層的クラスタリング 
    他 

    付録A NumPy 入門 
    A.1 NumPy のimport 
    他 

    付録B Scanpy を使ったシングルセル解析 
    B.1 Scanpy のimport 
  • 出版社からのコメント

    汎用言語Pythonで今日から始めるバイオインフォマティクス
  • 内容紹介

    Pythonでバイオインフォに取り組み、いずれは機械学習など始めたい方に。汎用的なテーブルデータ解析、可視化ライブラリを用いて、生命科学特有のシングルセル、RNA-Seq解析を実装しつつ学べる。
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